O ex-comandante-em-chefe da FAU e ex Chefe do Estado Maior da Defesa (Esmade) recebeu esta nomeação nas últimas horas, substituindo Augusto Gregori, que renunciou dias antes, em sua segunda tentativa nos últimos meses, desta vez sugerida pelo presidente Mujica, deixando o cargo por causa de desentendimentos com vários altos funcionários do governo, como o ministro da Defesa, Eleuterio Fernández Huidobro e outros referentes.
Gregori, sendo um tupamaro de origem politicamente radical, no entanto, advertiu contra a proliferação de ONGs e entidades ambientalistas alternativas, a partir do exemplo de alguns grupos bastante extremistas que defendem fortemente a economia de escambo, como perigos potenciais, sendo recusadas estas sugestões por parte das autoridades de Defesa e Interior e do Pro Secretário Regional da Presidência , que, juntamente com as discrepâncias com alguns aspectos da futura Lei de Inteligência, que, embora finalmente aceitou (após te-lo relutado) como o controle parlamentar, mesmo assim manteve diferenças marcantes com a oposição.O General Bonilla, que enquanto liderava a Esmade, por exemplo, tinha claramente algumas preocupações voltadas com as questões ambientais as vezes gravemente negligenciadas como um problema de Segurança, Inteligência e Defesa nacional , como a recentemente comprovada grande degradação das fontes de água potável do entorno de Montevidéu e do solo por abuso grosseiro de agrotóxicos, com razão, deve agora implementar o funcionamento do futuro Sistema Nacional de Inteligência, órgão que vai centralizar as atividades das diferentes agências especializadas dos ministérios de Defesa, do Interior, das Relações Exteriores e Economia e Finanças, e de outras instituições específicas. (Javier Bonilla)