Se ha divido la franja costera en tres sectores: Norte, Centro y Sur, enfocadas especialmente en la zona norte, donde se ha reportado el mayor índice delictivo. La Armada del Ecuador con el empleo de sus unidades tiene a cargo la custodia de una superficie de alrededor de 1.600,000 Km², cuya cobertura geográfica comprende el espacio marítimo que incluye el Mar Territorial, la Zona Contigua (ZC) y la Zona Económica Exclusiva (ZEE), su espacio aéreo y el lecho marino, además del espacio rivereño fluvial con sus aguas interiores, esteros, redes fluviales navegables, en donde exista actividad humana, tanto en la región continental e insular.
Para mejorar los tiempos de reacción y optimización de los recursos navales, las unidades de superficie están enlazadas con un sistema de vigilancia marítima fortalecido con el Sistema Integral de Gestión Marítima y Portuaria (SIGMAP), lo que permite mantener un monitoreo satelital de la actividad marítima, con capacidad de respuesta inmediata priorizando las medidas disuasivas y previendo la aplicación de la fuerza de manera progresiva y proporcional.
